Su primer resultado grabado de Croacia como asociado a la FIFA fue un empate a un gol con Eslovaquia el 8 de septiembre en Bratislava. Además, el jugador del Getafe Javier Casquero, autor del gol y exjugador del Racing, provocó al público con gestos y se burló de los jugadores racinguistas por la eliminación del equipo cántabro, lo que causó revuelo al final del encuentro entre las filas de la plantilla del Racing y el jugador rival. El encuentro se saldó con victoria de los maños (1-2), condenando al Deportivo de La Coruña al descenso. Sin embargo, y a pesar de las dificultades, Manolo Salvador y el técnico lograron formar un equipo competitivo para la categoría, disipando los temores de un nuevo descenso. En la clasificación acabó último con 26 puntos, a 17 de la salvación, y, tras perder 2-0 contra el Recreativo de Huelva el 27 de abril de 2008, consumó su descenso matemático a Segunda División. El 16 de abril de 2008, Gianni De Biasi dimitió al ver imposible la salvación del conjunto granota. Los jugadores, hartos de no cobrar durante año y medio, amenazaron con iniciar una huelga, con lo que se negaron a jugar los partidos de liga Recreativo-Levante y Levante-RCD Espanyol; sin embargo, el sábado 26 de abril de 2008, se llegó a un acuerdo con el club, que pagaría 10 de los 18 millones de euros que les debían.
Tocó fondo en la jornada 31, en la que encajó una sonrojante derrota 0-4 en casa ante el colista en ese momento, el RC Deportivo de La Coruña. En la tercera jornada logró un empate ante el Málaga CF, mientras que en la cuarta jornada sufre una derrota por 0-5 ante el FC Barcelona. Finalmente, pese a los problemas, el Levante consiguió la salvación matemática en la jornada 35 en un empate en casa ante el Real Zaragoza, acabando en la undécima posición con 46 puntos. El Levante comenzó la temporada con dos derrotas, ante el Villarreal CF y el Athletic Club. En la décima jornada, el Levante vuelve a ganar, en este caso a la U. D. Almería, por 2-1, en la undécima jornada empata a uno frente al Sevilla FC, y en la jornada doce, vence en el derbi valenciano al Valencia CF por 2-1. En la jornada 13 vence al Real Club Deportivo Español por 2-1. El Levante, a partir de esa victoria, encadena tres empates consecutivos, y en la jornada 17 pierde por 3-1 ante el Atlético de Madrid con un doblete de Antoine Griezmann y un gol de Diego Godín. En dieciseisavos se venció por goleada a un histórico como el Olympiakos FC (3-0 en el Ciudad de Valencia y 0-1 en Grecia).